devindocker package logo for development in docker container

2020-11-07 / Sébastien Rochette / développement, docker, package, rstudio, thinkrverse

Comment développer dans un conteneur Docker pour faciliter la collaboration ?

Pour assurer la reproductibilité de vos projets, vous pouvez développer dans le conteneur Docker que vous utiliserez pour partager votre travail. En effet, que faire quand vos analyses de données, publications, modèles sont pris en mains par des utilisateurs ayant des versions différentes de systèmes d’exploitation et de packages R ? Comment vous assurez que le Dockerfile livré avec votre ...

2020-10-26 / Vincent Guyader / astuces, développement, git, rstudio

Modifier le prompt de RStudio pour afficher la branche git active

Au dernier meetup Raddicts paris , Romain Francois (à suivre sur twitter ici) a fait forte impression, entre autre, avec sa console RStudio qui indique la branche git active ainsi que la mémoire RAM utilisée par R. Si vous aussi vous voulez avoir ceci (pour briller en société ou parce que vous passez votre temps à faire des git checkout): ...

A HTML report created from git messages using gitdown package

2020-08-10 / Sébastien Rochette / astuces, développement, git, package, thinkrverse

Télécharger les issues Gitlab ou Github et faire un rapport résumé de vos commits

En travaillant sur notre package {gitdown}, je voulais montrer plus d’informations sur le rapport généré en récupérant tous les tickets de mes dépôts Gitlab / Github. En effet, ajouter des titres aux numéros d’issues pourrait améliorer la lisibilité et l’information du rapport git de ce package. Comment puis-je télécharger toutes les informations des issues des dépôts git ? Contexte du ...

Transform a directory of flles to gitlab or github, using git

2020-08-10 / Sébastien Rochette / développement, astuces, git

Transformer un dossier en projet git synchronisé sur Github ou Gitlab

Vous avez travaillé pendant des années sur vos scripts R, et avez enregistré toutes les versions avec des noms comme “script_v1.R”, “script_v2.R”, “script_v2_meilleur_du_monde.R”, … Un jour, vous avez entendu parler de git, un système de versionnage qui vous permet de faire voyager vos fichiers à travers le temps. Mais comment transformer un dossier de fichiers faussement versionnés en dépôt git ...

2020-06-10 / Colin Fay / développement, package, shiny, thinkrverse

Qu’est-ce qu’une application Shiny « successful » ?

Une des chose que nous prêchons au sein de l’équipe ThinkR sont les bonnes pratiques de développement en R, pour la production. Bien sûr, cela s’applique également aux applications Shiny – et encore plus si nous touchons au package {golem}, qui promeut les bonnes pratiques pour du Shiny « de qualité production ». Mais prenons un peu de recul et réfléchissons à ...

migration-to-r4.0-in-ubuntu-20.04-header

2020-05-02 / Sébastien Rochette / ubuntu, cartographie, serveur

Installation de R 4.0 sur Ubuntu 20.04 LTS et astuces pour les packages de cartographie

Vous prévoyez de mettre à niveau votre installation serveur d’Ubuntu 18.04 vers Ubuntu 20.04 LTS ? C’est aussi le meilleur moment pour migrer vers R 4.0 ! Par ailleurs, si vous trouvez toujours difficile d’installer des packages R pour les données géographiques sur Ubuntu, c’est fini ! Suivez le guide… La dernière fois que vous avez lu ce genre de ...

dash-with-golem_header

2019-08-19 / Sébastien Rochette / développement, docker, package, serveur, shiny, thinkrverse

Dash avec golem : premier contact

{golem} a été développé pour aider à construire de grosses applications Shiny à mettre en production. Et si {golem} pouvait être utilisé pour construire une autre application web interactive populaire, récemment mise à la disposition des programmeurs R : Dash? Dash, un nouveau venu dans les applications web interactives Il y a quelques jours, Plotly a annoncé que Dash était ...

blogrmdfirst_header

2019-07-09 / Sébastien Rochette / développement, astuces, package, Rmarkdown

Rmd first : Quand le developpement commence par la documentation

La documentation c’est important ! Pensez à votre avenir et à celui des autres. Quel que soit le but de votre script et de vos analyses, pensez à la documentation. Dans ma tête, la structure du package R est faite pour ça. Je vais tenter de vous en convaincre. À use’R 2019 à Toulouse, j’ai fait une présentation intitulée : ...

2019-07-04 / Vincent Guyader / shiny

La communication entre modules et ses caprices

Dans le cadre du développement d’une application Shiny pour la production à l’aide du package {golem}, nous recommandons, entre autres, de travailler avec les Shiny-modules. La communication des données entre les différents modules peut s’avérer complexe. Chez ThinkR nous utilisons une stratégie : la stratégie du petit r. Nous vous expliquons tout dans cet article. Qu’est-ce qu’un module ? Un ...

2019-05-07 / Sébastien Rochette / astuces, développement, package, thinkrverse

{attachment} est sur le CRAN

Yeah ! Notre package {attachment} est maintenant disponible sur CRAN. {attachment} est là pour aider à gérer les dépendances pendant le développement de vos packages. Il fournit également des outils utiles pour installer ou lister les packages manquants utilisés dans des scripts R ou des Rmds. Gérer les dépendances pendant le développement de packages Si vous avez déjà eu l’erreur ...

2019-05-02 / Colin Fay / package, shiny, thinkrverse

Développer une app Shiny dans un package

Une Shiny App dans un Package Dans un article précédent, j’ai présenté{golem}, qui est un framework pour la création d’applications Shiny prêtes à partir en production. Ce cadre commence par la création d’un squelette de package en attente d’être rempli. Mais, dans un monde où les applications Shiny sont le plus souvent créées sous la forme d’une série de fichiers, ...

2019-04-28 / Sébastien Rochette / astuces, base de données, docker

Interagir avec PostGIS depuis R

PostGIS est une extentions de base de données PostgreSQL pour traiter les données spatiales. Grâce à PostGIS, votre base de données prend en charge les requêtes géographiques à exécuter directement en SQL. Dans ce post de blog, nous allons nous connecter et interagir avec une base de données PostGIS depuis R, en utilisant {DBI} et {sf}.. Le package {sf} et ...

2019-03-08 / Sébastien Rochette / astuces, cartographie, dataviz

SatRday Paris: Créer des images de gaufres interactives

Les outils cartographiques peuvent-ils être détournés vers d’autres usages ? Bien sûr ! Voyez comment nous jouons avec leaflet et leafgl pour rendre rapidement une énorme gaufre faîtes de millions de polygones. Les outils de cartographie ne sont pas seulement faits pour les données géographiques À SatRday Paris, j’ai fait une présentation intitulée “Tout sauf les cartes avec des outils ...

2019-03-04 / Colin Fay / développement, package, shiny

Vers un workflow pour des applications shiny prod-ready — 2/2

Deuxième partie de la transcription de la conférence que j’ai donnée lors de la session poster de la rstudio::conf(2019). Lire la première partie ici. Cet article est à la base de l’écriture de notre livre : https://engineering-shiny.org/. Vous y trouverez des informations complémentaires. Construire des applications Shiny prod-ready, étape par étape Etape 1: Design Ne vous précipitez pas dans le ...