Rédaction de guides de bonnes pratiques pour le développement et la mise en production de traitements de données sensibles

Contexte et enjeux de la mission

Cette entreprise pharmaceutique se lance dans la mise en production d’applications Shiny et de scripts d’analyses de données avec R, après avoir utilisé SAS pendant de nombreuses années. Les développements au sein des entreprises pharmaceutiques sont très réglementés. Ils nécessitent une documentation détaillée, des processus vérifiés, validés et testés à toutes les étapes. La migration depuis SAS requiert de ré-écrire tous les protocoles dans le cadre de développement avec R, dans le respect de la réglementation sur la transparence des processus d’analyses des données.

Notre intervention

• Décryptage du contexte et des attendus
• Réflexion sur les outils existants ou manquants dans l’écosystème R pour répondre à ces besoins de traçabilité
• Proposition d’une méthode de travail adaptée aux contraintes des outils internes du client
• Rédaction de guides de bonnes pratiques dédiés au processus de développement avec R

Résultat & valeur ajoutée

• Quatre guides de bonnes pratiques à destination des agents et des prestataires extérieurs, quelque soit leur niveau :
  • Processus de développement au format package
  • Écriture de code R (lisibilité du code, etc.)
  • Configuration et utilisation de git pour le versionnement de code
  • Reproductibilité (exemples reproductibles, documentation et tests)
• Montée en compétences des « product owners » en interne sur les bonnes pratiques de développement et sur git